見学実施研究室一覧

	上皮形態形成研究チーム　Yu-Chiun WANG Epithelial tissue deforms to produce body and organ structures. We use a multiscale, quantitative approach, combining genetics, live imaging and optogenetics to study the interplay between gene expression, mechanical forces and cell polarity during this process. 上皮は、体や臓器の構造を作り出すために変形します。私たちは、この上皮の変形の分子機構を理解するために、遺伝学・ライブイメージング・オプトジェネティクスを組み合わせて、多階層で定量的な手法をとることで、遺伝子発現・力学的な力・細胞極性の相互作用を研究しています。
	比較コネクトミクス研究チーム　宮道和成私のたちの一生の間に神経回路はどのように変化するでしょうか？当研究室は、主にマウスをモデルに、性成熟や妊娠・出産など大きなライフイベントに伴う神経回路の変化を捉え、その分子機構や意義を研究しています。
	ヒト器官形成研究チーム　髙里実私たちは、試験管内で任意の臓器を完全な形で創り上げることが、その再生医療研究の究極的な目標の一つであると考えています。この目標に近づくため、当研究チームでは、ヒトiPS細胞から腎臓オルガノイドを作成する系を利用して、移植可能な、更に高次のレベルの腎臓組織の構築を目指すとともに、腎臓以外の尿路系組織の再構築にも挑戦しています。また、純粋なヒト発生学への貢献も目指し、分化誘導過程のヒトiPS細胞の挙動を詳しく観察することで、ヒトの中胚葉系臓器や腎臓の発生メカニズムを解明したいと考えています。
	呼吸器形成研究チーム　森本充私たちの研究室では、呼吸器を題材に、臓器の発生、再生、疾患の研究に取り組んでいます。マウスおよびヒトの組織幹細胞に注目し、マウス遺伝学やオルガノイド培養を駆使し、呼吸器の成熟と、成体での組織損傷からの再生現象、病変の分子機構を解析しています。最近では１細胞シークエンスによる幹細胞の起源の探索、オルガノイドを使った肺線維症モデルの作成、発生過程における呼吸器組織構造の構築原理の解明とES細胞からの再生、移動する肺細胞の細胞生物学的解析に取り組んでいます。
	発生動態研究チーム　大浪修一私たちの研究室では、主に光学顕微鏡ライブイメージングと画像情報処理、ビッグデータ解析、計算機シミュレーションの技術を駆使し、多細胞システムの４次元的な動態の定量的な計測や、数理モデルの構築、未来の予測等を行う技術を開発し、多細胞生物の発生と多細胞システムの創成の予測可能な理解を目指した研究開発を展開しています。
	発生エピジェネティクス研究チーム　平谷伊智朗私たちは、既存の解析⼿法では⾒えていないエピゲノム変化を明らかにすべく、メガベース（100万塩基対）単位のゲノム三次元⾼次構造（＝3Dゲノム）に着⽬し、胚発⽣・細胞分化に伴う3Dゲノム変化を１細胞レベルで全ゲノム解析しています。1細胞データを丹念に⾒ていくことで、3Dゲノム変化を⽣み出す仕組みの解明に取り組み、ゲノム・染⾊体が持つ知られざるポテンシャルを明らかにしたいと考えています。
	染色体分配研究チーム　北島智也哺乳類卵母細胞における染色体分配の機構を研究しています。ライブイメージングや分子生物学、細胞生物学、生殖工学的なアプローチを使っています。卵子の老化で見られる染色体数異常の原因を明らかにしたいと考えています。
	心臓再生研究チーム　木村航哺乳類の成体には心筋再生能力がありませんが、胎児期や生後すぐの新生児期の心筋には再生能力があります。我々の研究室では、環境変化により心筋再生能が制御される分子的・進化的機構を明らかにし、新しい心臓再生の方法を確立することを目指します。
	動的恒常性研究チーム　Sa Kan YOO 生物は、傷や病気、老化といった、生体内の恒常性の破綻にある程度まで対応することができます。その結果、恒常性の回復を達成できることもあれば、組織や最終的には個体の死に至ることがあります。私たちは、このような現象を、遺伝学的アプローチやイメージングのできる実験系に落とし込むことで、そのメカニズムを、細胞・組織・個体レベルで明らかにすることを目指します。具体的には、ショウジョウバエを使い、老化・癌・細胞死・栄養といった切り口で研究を行なっています。
	細胞システム動態予測研究チーム　　城口克之光学顕微鏡を用いた蛋白質１分子動態観察と次世代シークエンサ関連の手法開発の経験を基に、バイオイメージング・シークエンシング・機械学習を組み合わせた新規１細胞計測法を開発しています。DNA分子バーコード法の開発により、高精度にRNA 分子を定量できるDigital RNA sequencing (dRNA-seq）を実現し、また、細菌の種類を高精度で区別して１細胞レベルで定量できる、新しい細菌叢解析法も開発しています。これらの技術開発を基盤として、生命システムの理解や、オルガノイドを用いた研究などにより医科学への貢献を目指しています。免疫に関わる細胞などを対象に、たくさんの共同研究も行っています。
	集積バイオデバイス研究チーム　　田中陽当研究室では、コンピュータの素子作製などに使われる半導体加工技術により作製した、髪の毛や蚊の針の太さ（10～100 μm）と同じかそれ以下のきわめて微小な構造体や流路などのデバイスを、化学やバイオ分野に展開することで、細胞や分子の精密な操作を可能とし、バイオ実験の集積化・次世代化を推進しています。また、未来の理想の機械のモデルを示すことを目標に、現在の科学技術では再現が難しい、生物の細胞や組織の特異的な機能に着目し、これと微細加工技術を融合した新原理の機械の創成に取り組んでいます。
	細胞極性統御研究チーム　　岡田康志近年の分子生物学と構造生物学の進歩は著しく、CG を駆使した美麗なイラストや動画を目にする機会も増えました。しかし、「生命とは何か？」には、まだ答えられません。私たちは、想像図ではなく、生きた細胞の中で生命現象の現場を分子レベルで直接見ることで「生命とは何か？」を理解したいと考え、そのための技術開発とそれを利用した計測に並行して取り組んでいます。具体的な研究対象としては、キネシンなどの分子モーターによる細胞内輸送を中心に、シグナル伝達分子の核輸送から遺伝子発現調節まで、細胞の中での輸送・動きを一分子レベルで直接イメージングすることで解析しています。
	フィジカルバイオロジー研究チーム　　柴田達夫個体はたくさんの種類の細胞から構成される多細胞システムです。1つの細胞が分裂を繰り返して個体ができあがる過程を理解するためには、遺伝子や分子から細胞へ、細胞から組織へ、組織から組織の集合へと、階層を一歩ずつ上がっていく必要があります。そのためには、最新の技術による生命現象の定量的な計測と、物理学や数学を基礎にした計算モデルやコンピュータシミュレーションが不可欠です。私たちの研究室では理論的アプローチと実験データ解析のアプローチを組み合わせて、細胞の情報処理、細胞の運動、細胞集団の協調的運動、遺伝子ネットワークの研究を進めています。
	脳エピトランスクリプトミクス研究チーム　Dan Ohtan WANG エピトランスクリプトミクスは、種類・部位特異的なRNA化学修飾に基づき、遺伝情報を読み取る新分野です。この転写後制御経路は中枢神経系において、多様かつ強力な役割を果たしていることが明らかになってきているが、その機能はまだ解明の途上です。我々は、定量的なオミックス技術、蛍光イメージング、細胞生物学、動物モデルを組み合わせて、この奥深い遺伝子制御の層を理解するための制御機構と分子経路を明らかにすることを目的としています。これらの知見は、認知機能の発達や衰え、自閉症や統合失調症などの神経疾患の理解に応用されます。Epitranscriptomic regulation of synapse dynamics over cognitive development and decline.
	栄養応答研究チーム　小幡史明我々の健康寿命は、食環境により大きく影響されていますが、そのメカニズムの多くは不明です。当研究室では、食餌によって変化する各種栄養素や腸内細菌の生理機能を研究しています。ショウジョウバエを利用し、生物の老化・寿命を規定する普遍的な分子機構を解明します。
	川口生体非平衡物理学理研白眉研究チーム　川口喬吾わたしたちは細胞集団運動のルールや細胞運命決定のメカニズムの解明を目指しており、主にライブイメージングと理論物理を組み合わせた研究をしています。最近では、細胞自身の作る幾何学的パターンやキラリティにより細胞流が自発的に生じる現象を見つけたため、画像解析やシミュレーション、理論モデルによりそれを説明する研究を進めています。

	上皮形態形成研究チーム　Yu-Chiun WANG Epithelial tissue deforms to produce body and organ structures. We use a multiscale, quantitative approach, combining genetics, live imaging and optogenetics to study the interplay between gene expression, mechanical forces and cell polarity during this process. 上皮は、体や臓器の構造を作り出すために変形します。私たちは、この上皮の変形の分子機構を理解するために、遺伝学・ライブイメージング・オプトジェネティクスを組み合わせて、多階層で定量的な手法をとることで、遺伝子発現・力学的な力・細胞極性の相互作用を研究しています。
	比較コネクトミクス研究チーム　宮道和成私のたちの一生の間に神経回路はどのように変化するでしょうか？当研究室は、主にマウスをモデルに、性成熟や妊娠・出産など大きなライフイベントに伴う神経回路の変化を捉え、その分子機構や意義を研究しています。
	ヒト器官形成研究チーム　髙里実私たちは、試験管内で任意の臓器を完全な形で創り上げることが、その再生医療研究の究極的な目標の一つであると考えています。この目標に近づくため、当研究チームでは、ヒトiPS細胞から腎臓オルガノイドを作成する系を利用して、移植可能な、更に高次のレベルの腎臓組織の構築を目指すとともに、腎臓以外の尿路系組織の再構築にも挑戦しています。また、純粋なヒト発生学への貢献も目指し、分化誘導過程のヒトiPS細胞の挙動を詳しく観察することで、ヒトの中胚葉系臓器や腎臓の発生メカニズムを解明したいと考えています。
	呼吸器形成研究チーム　森本充私たちの研究室では、呼吸器を題材に、臓器の発生、再生、疾患の研究に取り組んでいます。マウスおよびヒトの組織幹細胞に注目し、マウス遺伝学やオルガノイド培養を駆使し、呼吸器の成熟と、成体での組織損傷からの再生現象、病変の分子機構を解析しています。最近では１細胞シークエンスによる幹細胞の起源の探索、オルガノイドを使った肺線維症モデルの作成、発生過程における呼吸器組織構造の構築原理の解明とES細胞からの再生、移動する肺細胞の細胞生物学的解析に取り組んでいます。
	発生動態研究チーム　大浪修一私たちの研究室では、主に光学顕微鏡ライブイメージングと画像情報処理、ビッグデータ解析、計算機シミュレーションの技術を駆使し、多細胞システムの４次元的な動態の定量的な計測や、数理モデルの構築、未来の予測等を行う技術を開発し、多細胞生物の発生と多細胞システムの創成の予測可能な理解を目指した研究開発を展開しています。
	発生エピジェネティクス研究チーム　平谷伊智朗私たちは、既存の解析⼿法では⾒えていないエピゲノム変化を明らかにすべく、メガベース（100万塩基対）単位のゲノム三次元⾼次構造（＝3Dゲノム）に着⽬し、胚発⽣・細胞分化に伴う3Dゲノム変化を１細胞レベルで全ゲノム解析しています。1細胞データを丹念に⾒ていくことで、3Dゲノム変化を⽣み出す仕組みの解明に取り組み、ゲノム・染⾊体が持つ知られざるポテンシャルを明らかにしたいと考えています。
	染色体分配研究チーム　北島智也哺乳類卵母細胞における染色体分配の機構を研究しています。ライブイメージングや分子生物学、細胞生物学、生殖工学的なアプローチを使っています。卵子の老化で見られる染色体数異常の原因を明らかにしたいと考えています。
	心臓再生研究チーム　木村航哺乳類の成体には心筋再生能力がありませんが、胎児期や生後すぐの新生児期の心筋には再生能力があります。我々の研究室では、環境変化により心筋再生能が制御される分子的・進化的機構を明らかにし、新しい心臓再生の方法を確立することを目指します。
	動的恒常性研究チーム　Sa Kan YOO 生物は、傷や病気、老化といった、生体内の恒常性の破綻にある程度まで対応することができます。その結果、恒常性の回復を達成できることもあれば、組織や最終的には個体の死に至ることがあります。私たちは、このような現象を、遺伝学的アプローチやイメージングのできる実験系に落とし込むことで、そのメカニズムを、細胞・組織・個体レベルで明らかにすることを目指します。具体的には、ショウジョウバエを使い、老化・癌・細胞死・栄養といった切り口で研究を行なっています。
	細胞システム動態予測研究チーム　　城口克之光学顕微鏡を用いた蛋白質１分子動態観察と次世代シークエンサ関連の手法開発の経験を基に、バイオイメージング・シークエンシング・機械学習を組み合わせた新規１細胞計測法を開発しています。DNA分子バーコード法の開発により、高精度にRNA 分子を定量できるDigital RNA sequencing (dRNA-seq）を実現し、また、細菌の種類を高精度で区別して１細胞レベルで定量できる、新しい細菌叢解析法も開発しています。これらの技術開発を基盤として、生命システムの理解や、オルガノイドを用いた研究などにより医科学への貢献を目指しています。免疫に関わる細胞などを対象に、たくさんの共同研究も行っています。
	集積バイオデバイス研究チーム　　田中陽当研究室では、コンピュータの素子作製などに使われる半導体加工技術により作製した、髪の毛や蚊の針の太さ（10～100 μm）と同じかそれ以下のきわめて微小な構造体や流路などのデバイスを、化学やバイオ分野に展開することで、細胞や分子の精密な操作を可能とし、バイオ実験の集積化・次世代化を推進しています。また、未来の理想の機械のモデルを示すことを目標に、現在の科学技術では再現が難しい、生物の細胞や組織の特異的な機能に着目し、これと微細加工技術を融合した新原理の機械の創成に取り組んでいます。
	細胞極性統御研究チーム　　岡田康志近年の分子生物学と構造生物学の進歩は著しく、CG を駆使した美麗なイラストや動画を目にする機会も増えました。しかし、「生命とは何か？」には、まだ答えられません。私たちは、想像図ではなく、生きた細胞の中で生命現象の現場を分子レベルで直接見ることで「生命とは何か？」を理解したいと考え、そのための技術開発とそれを利用した計測に並行して取り組んでいます。具体的な研究対象としては、キネシンなどの分子モーターによる細胞内輸送を中心に、シグナル伝達分子の核輸送から遺伝子発現調節まで、細胞の中での輸送・動きを一分子レベルで直接イメージングすることで解析しています。
	フィジカルバイオロジー研究チーム　　柴田達夫個体はたくさんの種類の細胞から構成される多細胞システムです。1つの細胞が分裂を繰り返して個体ができあがる過程を理解するためには、遺伝子や分子から細胞へ、細胞から組織へ、組織から組織の集合へと、階層を一歩ずつ上がっていく必要があります。そのためには、最新の技術による生命現象の定量的な計測と、物理学や数学を基礎にした計算モデルやコンピュータシミュレーションが不可欠です。私たちの研究室では理論的アプローチと実験データ解析のアプローチを組み合わせて、細胞の情報処理、細胞の運動、細胞集団の協調的運動、遺伝子ネットワークの研究を進めています。
	脳エピトランスクリプトミクス研究チーム　Dan Ohtan WANG エピトランスクリプトミクスは、種類・部位特異的なRNA化学修飾に基づき、遺伝情報を読み取る新分野です。この転写後制御経路は中枢神経系において、多様かつ強力な役割を果たしていることが明らかになってきているが、その機能はまだ解明の途上です。我々は、定量的なオミックス技術、蛍光イメージング、細胞生物学、動物モデルを組み合わせて、この奥深い遺伝子制御の層を理解するための制御機構と分子経路を明らかにすることを目的としています。これらの知見は、認知機能の発達や衰え、自閉症や統合失調症などの神経疾患の理解に応用されます。Epitranscriptomic regulation of synapse dynamics over cognitive development and decline.
	栄養応答研究チーム　小幡史明我々の健康寿命は、食環境により大きく影響されていますが、そのメカニズムの多くは不明です。当研究室では、食餌によって変化する各種栄養素や腸内細菌の生理機能を研究しています。ショウジョウバエを利用し、生物の老化・寿命を規定する普遍的な分子機構を解明します。
	川口生体非平衡物理学理研白眉研究チーム　川口喬吾わたしたちは細胞集団運動のルールや細胞運命決定のメカニズムの解明を目指しており、主にライブイメージングと理論物理を組み合わせた研究をしています。最近では、細胞自身の作る幾何学的パターンやキラリティにより細胞流が自発的に生じる現象を見つけたため、画像解析やシミュレーション、理論モデルによりそれを説明する研究を進めています。